Są używane przed i po dokonanych zabiegach w jamie ustnej. Heart Association jest temu przeciwna.
Na całym świecie przepisuje się antybiotyki przed zabiegami chirurgii dentystycznej, takimi jak: usuwanie zębów, skrobanie dziąseł, umieszczanie implantów, podnoszenie żuchwy, przeszczep miękkich tkanek. Dentysta uważając, że chroni pacjenta przypisuje mu antybiotyki do zastosowania przed i po zabiegu. Według własnego uznania zaleca dozowanie i czas trwania terapii, chociaż od lat zrzeszenia naukowe proponują zahamowanie zjawiska będącego absolutnie poza kontrolą.